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单细胞测序

单细胞测序为植物细胞分子图谱的绘制提供帮助

Single-cell RNA sequencing resolves molecular relationships among individual plant cells

期刊: Plant Physiology
影响因子:6.305
发表单位:University of Michigan
发表时间: 2019年2月

一、研究背景

迄今为止,单细胞基因表达分析还没有广泛应用到植物中,部分原因是由于植物细胞存在的细胞壁抑制了分离以及单个细胞的获取。单细胞基因表达研究报道,到目前为止,植物的文章 发表有限,尽管人们已经认识到植物中大规模单细胞转录组研究的潜在益处,本文基于10X Genomics chromium平台,分析了拟南芥根部约10,000个细胞(原生质体)的转录组数。

二、研究结论

基于10X Genomics chromium 平台,分析了拟南芥根部约10,000个细胞(原生质体)的转录组数据,从中发现了主要的组织类型以及发育不同阶段的细胞,此外还鉴定出较为稀有 的细胞亚群;在此基础上,该研究重点分析了根部表皮细胞,基于拟时分析展示了分生组织发育过程中 hair 细胞与 non-hair细胞的分化轨迹。

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