英文标题：A multiomics dataset for the study of RNA modifications in human macrophage differentiation and polarisation
客户单位：悉尼大学
发表时间：2024年2月
发表期刊：Scientific Data（IF=9.8）
技术手段：Ribo-seq、RNA-seq、MeRIP-seq
样本情况：分化+极化+抗炎状态+促炎状态人巨噬细胞

巨噬细胞的分化和极化与多种疾病的发生发展有关，如自身免疫疾病、慢性炎症、肿瘤和代谢性疾病。本文章对两种状态的巨噬细胞进行多组学联合分析（Ribo-seq、RNA-seq、MeRIP-seq以及LC-MS/MS），研究结果涵盖了从转录本到蛋白质全过程的基因表达情况。在转录组、翻译组以及蛋白组三个层面上，巨噬细胞分化和极化状态特征和功能相关基因特征显著富集，显示了基因表达调控具有生物学一致性。在RNA m6A修饰层面，与之前的研究一致，m6A peak主要在CDS以及3 'UTR区富集，并且m6A识别motif序列为DRACH。此研究提供的数据集为进一步研究巨噬细胞中基因表达情况提供了有用的资源。

Ribo-seq、MeRIP-seq以及RNA-seq揭示分化/极化状态巨噬细胞基因表达模式