J9九游会

J9九游会

 > 

科技服务

 > 

基因组测序

三代建库测序服务

常见问题

  • Q

    1. 三代测序准确率如何??

    三代测序的碱基错误率是随机产生的,通过增加测序深度,能够迅速提升准确性(一般覆盖到10X以上,正确率可以达到99.9%);无测序偏好性:可以最大程度上还原基因实际情况;三代reads平均读长为12kb,可以比较均匀的覆盖参考基因组,明确比对到相应区域,避免假阳性的同时,得到更加准确的变异位点和类型。

  • Q

    2. 三代测序应用有哪些?

    提升复杂基因组组装指标
    直接获得全长转录组信息
    直接读取原始数据中DNA甲基化修饰信息



  • Q

    3. Pacbio 平台的产出情况如何?

    目前最新的 Pac bio Sequel 平台 CLR 模式单张芯片产出在 100-150  G 之间, CCS 模式产出大概在 250-300  G 之间,具体的产出与文库质量、文库大小相关。一般 de novo 项目文库类型为 CLR-20K、CLR40K、CCS-15K , CLR 模式平均读长在 10-20k , subreads N50长度在20-30K 之间 。CSS模式平均读长在10-15K,subreads N50长度在10-15K之间 。

  • Q

    4. CLR 和 CCS 的区别在哪?

    CLR的插入片段长,对文库的测序 < 2 passes (从接头读到接头),这样的   reads 测序错误率等同于原始的测序错误率, 主要用于基因组  de novo  时的大片段文库测序,一般插入片段大小>15K;CCS的插入片段短,对文库的测序 ≥ 2 passes,将相同的 subreads整合后产生的 CCS reads 准确率会有显著的提升,可用于全长转录组、全长16s、变异检测等较小片段文库测序,一般插入片段大小在 10k左右。



  • Q

    5. Nanopore 平台的产出情况如何?

    目前 PromethION 平台单张芯片普通文库产出能稳定在 60G,最高可到 100G 以上。一般 de novo 项目文库下机数据的平均读长在 15-20K,read length N50 在 30-40K。对于 Ultra-long reads 文库,其平均读长可达到30-40K,read length N50 更能达到 50K 以上,产出大概在 40G 左右。

Copyright@2011-2024 All Rights Reserved    版权所有:J9九游会    京ICP备15007085号-1

一对一业务咨询

一对一业务咨询

在线客服

联系方式

联系电话

400-658-1585

企业邮箱

service@novogene.com
返回顶部
Sitemap