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基因组测序

宏基因组测序(二代)

代谢通路分析

通过KEGG基因功能注释,分析各样品中与关键功能相关的代谢通路中基因的分布情况,及其丰度情况,比较不同分组间关键代谢通路的差异。从功能基因及代谢通路的层面来说明对照样品的关键物质代谢路线及含量差异的原因。

组间物种与功能差异统计检验分析

  • MetaGenomeSeq 分析

    为了研究组间具有显著性差异的物种或功能,从不同层级的物种或功能丰度表出发,利用 MetaGenomeSeq方法对组间的物种或功能丰度数据进行假设检验得到 p 值,通过对 p 值的校正,得到 q 值;最后根据 q 值筛选具有显著性差异的物种或功能,并绘制差异物种或功能在组间的丰度分布箱图。
  • iPATH 分析

    为了研究不同分组(不同样品)在代谢通路图中的差异,绘制了代谢通路网页版结果展示。

抗性基因分析

通过CARD数据库的注释,可以找到抗生素抗性基因、以及作用机制等信息,抗性基因Overview圈图可以从整体上观察各样品中抗性基因丰度占比,更加直观的展示各抗性基因丰度的整体分布情况。

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