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定制化液相芯片

芯片性能测试报告

测试数据分析结果包含了目标区域指标汇总、性能雷达图、不同区域覆盖情况等内容,全面而详细地展示了芯片的各项性能。
目标区域指标汇总(表一)
Sample 24R00300CS 24R00301CS 说明
Raw bases(Mb) ** ** 原始数据总碱基数
Clean bases(Mb) ** ** Clean data总碱基数
QCrate(%) ** ** 过滤比率Clean
bases(Mb)/Raw
bases(Mb)
Target average read length ** ** 目标区域平均序列长度
Target average base quality ** ** 目标区域平均碱基质量
Target average insert size ** ** 目标区域平均插入片段长度
Target duplicated bases(Mb) ** ** 目标区域重复碱基数
Target duplication rate(%) ** ** 目标区域重复碱基率
Total mapped reads(M) ** ** 总共比对到参考基因组上的序列数
Total reads mapping rate(%) ** ** 序列比对率
Target mapped reads(M) ** ** 比对到目标区域上的序列数
Target reads capture rate(%) ** ** 序列捕获效率,Target mapped
reads(M)/Total mapped
reads(M)
Flank mapped reads(M) ** ** 比对到目标区域及侧翼
150bp上的序列数
Flank reads capture rate(%) ** ** 目标区域及侧翼
150bp的捕获效率
Target size ** ** 目标区域大小
Target covered size ** ** 目标区域实际覆盖到的大小
Coverage rate(%) ** ** 覆盖率
Target effective bases(Mb) ** ** 目标区域上的有效碱基数,
去除了重复序列碱基
Target effective rate(%) ** ** 有效碱基率
Target mean depth ** ** 目标区域平均深度
(以总目标区域为分母)
T4X coverage rate(%) ** ** 深度>=4X的目标区域比率,
也叫4X覆盖度
T 10X coverage rate(%) ** ** 深度>=10X的目标区域比率,
也叫10X覆盖度
T 20X coverage rate(%) ** ** 深度>=20X的目标区域比率,
也叫20X覆盖度
T 30X coverage rate(%) ** ** 深度>=30X的目标区域比率,
也叫30X覆盖度
T 10%X coverage rate(%) ** ** 深度>=平均深度10%X
的目标区域比率
T 20%X coverage rate(%) ** ** 深度>=平均深度20%X
的目标区域比率
T 30%X coverage rate(%) ** ** 深度>=平均深度30%X
的目标区域比率
T50%X coverage rate(%) ** ** 深度>=平均深度50%X
的目标区域比率
性能指标(表二)
指标 QC Mapping Dup Capture Coverage 20%X-coverage
预期 90 95 30 41 98 90
实际 95.21 98.14 23.76 79.14 99.69 94.75

性能指标 J9九游会定制化液相芯片重要指标:位点检出率、突变一致性、稳定性均>99%,行业领先。

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