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送样建议

单菌(真菌\细菌)

声明:
实验室不接收《人间传染的病原微生物名录》(点击查看)的所有样品。对于高毒性动植物等样品,必须事先通过销售、客服或运营经理与J9九游会技术人员联系,确定无高致病性和传染性后才能寄送样品。
提取风险提示和注意事项:核酸提取质量与物种及组织部位、采集方法及保存状态、提取方法及操作、实验器材及环境等因素均有密不可分的联系,尤其是三代超长提取对样本的要求更高。组织提取时可能受到上下游处理操作的影响,因此较难保证单次提取满足质量要求,客户应在寄送组织样品前进行备份。为了保障获得高质量的核酸,请务必按照送样手册所规定的准备样本。对珍贵样本或者微量样本,建议自行提取。取样过程中,需要全程佩戴手套,并且使用预冷乙醇对取样器材进行擦拭消毒,以免样本污染

1. 单菌(真菌、细菌)

  • 1.1 组织样本

    a. 样本量:菌体≥2g,-80℃保存,干冰寄送
    b. 样本准备:对数期4ml菌液,4000×g离心10min(4℃),弃上清,沉淀(对应菌液离心)用无菌水洗2次后干冰送样,建议送2-3个平行,避免一次提取不成功
    c. 甘油保存的样本,需要重新液体培养基(例如 LB)活化到对数期,不可直接送甘油保存的菌株
    d. 不建议送固体培养皿的菌,如是只有固体培养基才能活,可以刮到有PB缓冲液的离心管里面,离心,送沉淀2g以上
    e. 真菌(>0.5g)大型菇类等,建议送菌丝,不建议送孢子或是子实体,杂合率较高,不利于组装
    f. 样本一定为非灭活样本,灭活会导致核酸严重降解
    g. 不接中国传染病原微生物名录里涉及的菌种样本  中国传染病原微生物名录
    【注】细菌和真菌DNA样本,请老师首先进行污染排查检测和物种鉴定,污染排查和物种鉴定方法:细菌可以扩增16s全长后送一代测序,真菌还需扩增ITS全长,确定物种正确,无其他杂菌污染再送样
    霉菌和蕈菌可能存在二倍体杂合度比较高的情况,而且也可能包含其他杂菌,如果直接提取DNA送样,会影响后续染色体组装效果,建议先进行纯化培养,多传几代,可以取孢子分离纯培养,然后再提取DNA送样
  • 1.2 核酸样本

    文库类型 浓度 体积 总量 备注
    DNA 小片段文库 >24ng/μl 20μl≤V≤120μl >400ng 针对核酸有杂质、污染、粘稠、颜色等情况,需要过柱纯化后送样 或者酌情增加送样量
    因部分客户核酸含有杂质、颜色等物质导致会产生大量损失,为保证您的样本一次检测合格并节约宝贵的重送样时间,送样建议量是高于公司判定标准的,请您在核酸量足够的前提下尽量按照送样建议来送样,感谢您的大力支持与配合。

2 样本打包及寄送建议

  • 2.1 样本的打包

    (1)核酸样品建议使用质量好的1.5ml或2ml 低吸附EP管装载样品,并用封口膜封口。为了防止样品管破裂,或者污染和混乱,请不要使用诸如PCR管、0.5ml EP管、八联管、96孔板、深孔板等非标准管送样。非标准管不利于样品保存以及后续实验的进行。如有样品使用非标准管制备,还请在送样前自行转管处理。
    (2)组织样本建议根据送样量使用合适规格带螺纹帽的EP管、冻存管或者离心管装载组织样品,并用封口膜封口。
    (3)为防止样品管在运输过程中受到干冰挤压破裂,最好将样品管放到50ml离心管或其他支撑物中,并在支撑物里添加棉花或卫生纸缓冲。大量样品建议将EP管放置在冻存盒中,并在冻存盒外面包裹气泡垫。如使用锡箔纸、自封袋装载的样品,为防止运输中受挤压破损,建议将锡箔纸折叠整齐装在自封袋中,在样品包装外再用气泡垫包好并固定。
    (4)对于血液样品,建议采用5-10ml 塑料抗凝采血管装载,为了防止运输过程中采血管因挤压而损坏,需要将每支采血管管身均用气泡垫包好,然后放置到塑料或纸质包装盒中。
    (5)用乙醇沉淀的样品由于运输中会有少量乙醇挥发出,建议将样品管盖用封口膜缠绕4-5圈。
    (6)为便于处理和保存,组织样品送样量请不要超过建议送样量的5倍(特殊的得率较低的样品除外)。
  • 2.2 样本的名称标识

    (1)所有的样品必须具有清晰的标记,并且简洁明了。
    (2)使用锡箔纸包装的组织样品建议在锡箔纸内外均标记样品名称,并将锡箔纸放在自封袋中,自封袋外面再标记上样品名称,防止锡箔纸上样品名称模糊引起样品混乱。
    (3)使用乙醇沉淀的核酸样品,由于挥发出的乙醇会使记号笔的标记模糊,建议用油性记号笔将样品名称写在标签纸上,然后用透明胶带将标签纸粘贴在样品管壁上,并缠绕2-3圈。
    (4)样品名称建议使用“字母+数字”命名方式标注在管盖。其他信息如日期、浓度、物种等可标注在管壁。所有标注内容需与《样品信息单》保持一致。

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