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质谱分析

CyTOF 质谱流式单细胞蛋白检测

SPADE分析

首先将表型类似的细胞聚成小群,然后依照各小群的表型相似度进行聚类分析,最后得到一个树形图。
每个节点都是由一群表型相似的细胞构成的,节点相对位置不同也体现了其表型的差异。

viSNE 分析

尽可能保持信息不丢失的基础上,将多维信息压缩到二维,这样就可以用二维散点图来展示高维数据的结构。
可以看出,在 viSNE 图谱中,几个主要免疫亚群各自聚群。

Wanderlust 分析

Wanderlust 会根据每个细胞排列的位置赋予细胞一个 Wanderlust 值,其大小就反映了分化程度。
以 B 细胞为例,0代表起点(造血干细胞),1代表终点(Immature Naive B),该数值越小说明细胞越原始。
有了这个工具,我们可以观察 B 细胞分化过程中任意一个蛋白的表达变化,这些信息可以帮助我们找到分化过程中一些重要的事件。

Wanderlust 分析

Wanderlust 会根据每个细胞排列的位置赋予细胞一个 Wanderlust 值,其大小就反映了分化程度。
以 B 细胞为例,0代表起点(造血干细胞),1代表终点(Immature Naive B),该数值越小说明细胞越原始。
有了这个工具,我们可以观察 B 细胞分化过程中任意一个蛋白的表达变化,这些信息可以帮助我们找到分化过程中一些重要的事件。

Citrus 分析

临床样本具有很大的异质性,比较有规律性、代表性的差别往往只存在于少数亚群中。Citrus 可分析识别出这些特征性亚群。

聚类热图

聚类热图可以简单地聚合大量数据,直观地展现数据的频率高低。

二维散点图

用来呈现数据点的分布,表现两个元素的相关性。

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